當(dāng)我們想要選擇一款自己需求的熒光定量PCR儀時(shí)該關(guān)注些什么呢?
1.儀器的檢測(cè)通量
在購買定量PCR儀的時(shí)候要根據(jù)實(shí)驗(yàn)室的需要來選擇不同通量的儀器。目前市面上的熒光定量PCR的檢測(cè)通量小到16個(gè)多到384個(gè)。如果進(jìn)行一般的基因表達(dá)研究或病原體檢測(cè),實(shí)在不必購買昂貴的儀器,96孔的通量足夠用;需要尋找要新藥靶點(diǎn)和疾病標(biāo)記的實(shí)驗(yàn)室可以考慮購買384孔板的儀器。假如經(jīng)費(fèi)有限,無法購買384孔板儀器的實(shí)驗(yàn)室,可以考慮購買運(yùn)行速度快(帶有FAST模塊)的96孔板熒光定量PCR儀。有了高通量的儀器,你會(huì)發(fā)現(xiàn)樣品的制備和小體系、多樣本的PCR體系構(gòu)建成為限制實(shí)驗(yàn)速度和結(jié)果的頸瓶。Roche公司推出的MagnaPure核算純化系統(tǒng)可配合Roche的Lightcycyler熒光定量PCR儀使用。Eppendorf 的ep Motion5070、5075全自動(dòng)工作站,即可解決核酸純化問題,又可進(jìn)行96孔板、384孔板的PCR反應(yīng)體系構(gòu)建,不用加樣加到眼發(fā)黑、手抽筋。
2.硬件設(shè)計(jì)特點(diǎn)
熒光定量PCR儀主要有傳統(tǒng)的96孔板式、創(chuàng)新的離心式等,每種設(shè)計(jì)都有它的獨(dú)到之處但也都有無法避免的缺憾。
傳統(tǒng)96孔板的熒光定量PCR可以容納的樣本量大,而且無需特殊的耗材。有些傳統(tǒng)的96孔板的儀器采用鹵鎢燈激發(fā)、CCD檢測(cè),這些光學(xué)結(jié)構(gòu)在96孔板的頂部,每個(gè)樣品孔距光源和檢測(cè)器的光程各不相同——邊緣效應(yīng),對(duì)結(jié)果產(chǎn)生影響。為了保證準(zhǔn)確的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,這類儀器在實(shí)驗(yàn)過程中通常會(huì)使用ROX(一種熒光染料)或Reference dye作為參照校正實(shí)驗(yàn)結(jié)果。鹵鎢燈的使用壽命短、更換成本較高已經(jīng)成為很多用戶頭痛的問題。在實(shí)驗(yàn)過程中鹵鎢燈作為一種熱光源,產(chǎn)生較多熱能對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果有一定的影響。CCD最大的優(yōu)點(diǎn)就是可以同時(shí)掃描所有樣品中的熒光信號(hào),但是靈敏度較低,而且同時(shí)檢測(cè)樣品間的熒光信號(hào)存在干擾。像ABI、Bio-rad公司生產(chǎn)的熒光定量PCR就屬于這一種。但Bio-rad的IQ系列熒光定量PCR帶有梯度功能。
創(chuàng)新的離心式的儀器通常選用LED激發(fā)、PMT檢測(cè),離心式的設(shè)計(jì)上避免了邊緣效應(yīng)。LED光源是冷光源對(duì)實(shí)驗(yàn)沒有影響,因此無需采用其他熒光染料校正儀器,而且使用壽命長無需經(jīng)常更換。PMT每次只能收集單個(gè)熒光信號(hào),但是檢測(cè)靈敏度高。但這類儀器運(yùn)行速度非?,但也存在樣本量小、耗材昂貴、沒有梯度功能、存在時(shí)間積分等缺點(diǎn)。Corbett 的Rotor-gene系列和Roche 的Lightcycler系列均為這一類儀器。
隨著熒光定量PCR技術(shù)的使用,聰明的儀器生產(chǎn)商紛紛在傳統(tǒng)的96孔板儀器上大作改進(jìn)。首先是Stratagene的Mx3000p在檢測(cè)上突破了使用CCD改用PMT檢測(cè)熒光信號(hào),大大提高了實(shí)驗(yàn)的靈敏度,但激發(fā)光源仍然沿用傳統(tǒng)的鹵鎢燈并且沒有梯度功能。Eppendorf公司推出的Mastercycler ep realplex是一款帶有梯度功能的熒光定量PCR儀,使用了96個(gè)LED為激發(fā)光源,采用第二代PMT及96合一光纖為檢測(cè)系統(tǒng),不但避免了邊緣效應(yīng)還保證所有樣品間的熒光信號(hào)沒有干擾。
3.運(yùn)行速度
在熒光定量PCR儀的眾多技術(shù)參數(shù)中,升降溫速度也是廠家喜歡大力宣傳的指標(biāo)。更快的升降溫,可以縮短反應(yīng)進(jìn)行的時(shí)間,而且縮短了可能的非特異性結(jié)合、反應(yīng)的時(shí)間,提高PCR的特異性。為了更好的完成實(shí)驗(yàn),各個(gè)廠家紛紛推出能快速運(yùn)行的熒光定量PCR儀。例如ROCHE推出的Lightcycler2.0利用空氣動(dòng)力學(xué)原理,可在半小時(shí)左右完成30-40個(gè)循環(huán)。ABI的7500可以選配FAST模塊擁有5°C/秒的升降溫速度,可在40分鐘左右完成30-40個(gè)循環(huán)。zui近eppendorf新推出的Mastercycler ep realplex4S 和2S的銀質(zhì)模塊熒光定量PCR儀 ,升降溫的速度可達(dá)到6℃/秒和4.5/秒,是目前同類產(chǎn)品中升降溫速度zui快的熒光定量PCR 儀。一個(gè)在其他儀器上原本需要40—60分鐘的PCR反應(yīng),eppendorf Mastercycler ep realplex4S 和2S (銀質(zhì)模塊)只需運(yùn)行28分鐘——?jiǎng)e小看這節(jié)約下來的幾十分鐘,一天下來就可以多運(yùn)行好幾輪了。
4.靈活性
大規(guī)模繁忙的實(shí)驗(yàn)室設(shè)備固然讓人羨慕,但是常規(guī)實(shí)驗(yàn)室同樣可以有精彩的選擇,F(xiàn)在的儀器供應(yīng)商擁有眾多技術(shù)專家,有的還能提供整個(gè)分子生物學(xué)的基礎(chǔ)研究平臺(tái),不但了解、滿足您現(xiàn)在的需求,而且還考慮到了你可能變化的需求——升級(jí)和更換模塊。Bio-rad的Mycycler就可以選擇模塊升級(jí)為定量PCR儀。ABI的7900可以選擇將96孔槽變?yōu)?84孔槽。像離心式的雙通道的Rotor-gene3000A 就可以根據(jù)您研究的需要升級(jí)成四通道的熒光定量PCR儀。Eppendorf公司在這方面考慮的就更加周全,如實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)擁有Mastercycler ep可以按照您的要求升級(jí)為Mastercycler ep realplex熒光定量PCR儀,而且可升級(jí)的型號(hào)有4種:2通道銀質(zhì)、鋁制模塊和4通道銀質(zhì)、鋁制模塊。您可以根據(jù)自己的經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)需要購買、升級(jí)任何一款Mastercycler ep realplex熒光定量PCR儀。
1.儀器的檢測(cè)通量
在購買定量PCR儀的時(shí)候要根據(jù)實(shí)驗(yàn)室的需要來選擇不同通量的儀器。目前市面上的熒光定量PCR的檢測(cè)通量小到16個(gè)多到384個(gè)。如果進(jìn)行一般的基因表達(dá)研究或病原體檢測(cè),實(shí)在不必購買昂貴的儀器,96孔的通量足夠用;需要尋找要新藥靶點(diǎn)和疾病標(biāo)記的實(shí)驗(yàn)室可以考慮購買384孔板的儀器。假如經(jīng)費(fèi)有限,無法購買384孔板儀器的實(shí)驗(yàn)室,可以考慮購買運(yùn)行速度快(帶有FAST模塊)的96孔板熒光定量PCR儀。有了高通量的儀器,你會(huì)發(fā)現(xiàn)樣品的制備和小體系、多樣本的PCR體系構(gòu)建成為限制實(shí)驗(yàn)速度和結(jié)果的頸瓶。Roche公司推出的MagnaPure核算純化系統(tǒng)可配合Roche的Lightcycyler熒光定量PCR儀使用。Eppendorf 的ep Motion5070、5075全自動(dòng)工作站,即可解決核酸純化問題,又可進(jìn)行96孔板、384孔板的PCR反應(yīng)體系構(gòu)建,不用加樣加到眼發(fā)黑、手抽筋。
2.硬件設(shè)計(jì)特點(diǎn)
熒光定量PCR儀主要有傳統(tǒng)的96孔板式、創(chuàng)新的離心式等,每種設(shè)計(jì)都有它的獨(dú)到之處但也都有無法避免的缺憾。
傳統(tǒng)96孔板的熒光定量PCR可以容納的樣本量大,而且無需特殊的耗材。有些傳統(tǒng)的96孔板的儀器采用鹵鎢燈激發(fā)、CCD檢測(cè),這些光學(xué)結(jié)構(gòu)在96孔板的頂部,每個(gè)樣品孔距光源和檢測(cè)器的光程各不相同——邊緣效應(yīng),對(duì)結(jié)果產(chǎn)生影響。為了保證準(zhǔn)確的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,這類儀器在實(shí)驗(yàn)過程中通常會(huì)使用ROX(一種熒光染料)或Reference dye作為參照校正實(shí)驗(yàn)結(jié)果。鹵鎢燈的使用壽命短、更換成本較高已經(jīng)成為很多用戶頭痛的問題。在實(shí)驗(yàn)過程中鹵鎢燈作為一種熱光源,產(chǎn)生較多熱能對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果有一定的影響。CCD最大的優(yōu)點(diǎn)就是可以同時(shí)掃描所有樣品中的熒光信號(hào),但是靈敏度較低,而且同時(shí)檢測(cè)樣品間的熒光信號(hào)存在干擾。像ABI、Bio-rad公司生產(chǎn)的熒光定量PCR就屬于這一種。但Bio-rad的IQ系列熒光定量PCR帶有梯度功能。
創(chuàng)新的離心式的儀器通常選用LED激發(fā)、PMT檢測(cè),離心式的設(shè)計(jì)上避免了邊緣效應(yīng)。LED光源是冷光源對(duì)實(shí)驗(yàn)沒有影響,因此無需采用其他熒光染料校正儀器,而且使用壽命長無需經(jīng)常更換。PMT每次只能收集單個(gè)熒光信號(hào),但是檢測(cè)靈敏度高。但這類儀器運(yùn)行速度非?,但也存在樣本量小、耗材昂貴、沒有梯度功能、存在時(shí)間積分等缺點(diǎn)。Corbett 的Rotor-gene系列和Roche 的Lightcycler系列均為這一類儀器。
隨著熒光定量PCR技術(shù)的使用,聰明的儀器生產(chǎn)商紛紛在傳統(tǒng)的96孔板儀器上大作改進(jìn)。首先是Stratagene的Mx3000p在檢測(cè)上突破了使用CCD改用PMT檢測(cè)熒光信號(hào),大大提高了實(shí)驗(yàn)的靈敏度,但激發(fā)光源仍然沿用傳統(tǒng)的鹵鎢燈并且沒有梯度功能。Eppendorf公司推出的Mastercycler ep realplex是一款帶有梯度功能的熒光定量PCR儀,使用了96個(gè)LED為激發(fā)光源,采用第二代PMT及96合一光纖為檢測(cè)系統(tǒng),不但避免了邊緣效應(yīng)還保證所有樣品間的熒光信號(hào)沒有干擾。
3.運(yùn)行速度
在熒光定量PCR儀的眾多技術(shù)參數(shù)中,升降溫速度也是廠家喜歡大力宣傳的指標(biāo)。更快的升降溫,可以縮短反應(yīng)進(jìn)行的時(shí)間,而且縮短了可能的非特異性結(jié)合、反應(yīng)的時(shí)間,提高PCR的特異性。為了更好的完成實(shí)驗(yàn),各個(gè)廠家紛紛推出能快速運(yùn)行的熒光定量PCR儀。例如ROCHE推出的Lightcycler2.0利用空氣動(dòng)力學(xué)原理,可在半小時(shí)左右完成30-40個(gè)循環(huán)。ABI的7500可以選配FAST模塊擁有5°C/秒的升降溫速度,可在40分鐘左右完成30-40個(gè)循環(huán)。zui近eppendorf新推出的Mastercycler ep realplex4S 和2S的銀質(zhì)模塊熒光定量PCR儀 ,升降溫的速度可達(dá)到6℃/秒和4.5/秒,是目前同類產(chǎn)品中升降溫速度zui快的熒光定量PCR 儀。一個(gè)在其他儀器上原本需要40—60分鐘的PCR反應(yīng),eppendorf Mastercycler ep realplex4S 和2S (銀質(zhì)模塊)只需運(yùn)行28分鐘——?jiǎng)e小看這節(jié)約下來的幾十分鐘,一天下來就可以多運(yùn)行好幾輪了。
4.靈活性
大規(guī)模繁忙的實(shí)驗(yàn)室設(shè)備固然讓人羨慕,但是常規(guī)實(shí)驗(yàn)室同樣可以有精彩的選擇,F(xiàn)在的儀器供應(yīng)商擁有眾多技術(shù)專家,有的還能提供整個(gè)分子生物學(xué)的基礎(chǔ)研究平臺(tái),不但了解、滿足您現(xiàn)在的需求,而且還考慮到了你可能變化的需求——升級(jí)和更換模塊。Bio-rad的Mycycler就可以選擇模塊升級(jí)為定量PCR儀。ABI的7900可以選擇將96孔槽變?yōu)?84孔槽。像離心式的雙通道的Rotor-gene3000A 就可以根據(jù)您研究的需要升級(jí)成四通道的熒光定量PCR儀。Eppendorf公司在這方面考慮的就更加周全,如實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)擁有Mastercycler ep可以按照您的要求升級(jí)為Mastercycler ep realplex熒光定量PCR儀,而且可升級(jí)的型號(hào)有4種:2通道銀質(zhì)、鋁制模塊和4通道銀質(zhì)、鋁制模塊。您可以根據(jù)自己的經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)需要購買、升級(jí)任何一款Mastercycler ep realplex熒光定量PCR儀。