脊椎動(dòng)物胚胎咽側(cè)壁的5對囊體。水棲脊椎動(dòng)物，這5對囊體向外突，在它相應(yīng)的外胚層部位向內(nèi)陷，兩者相遇并打通，形成由咽部與外界相通的鰓裂。陸棲脊椎動(dòng)物用肺呼吸，但在胚胎期也形成5對咽囊，這些咽囊在發(fā)育中形成一系列衍生結(jié)構(gòu)：第一對咽囊的遠(yuǎn)端部膨大形成中耳鼓室，其近端部仍保留著和咽的聯(lián)系，成為耳咽管；第二對咽囊在哺乳類形成腭扁桃體，在其他陸棲脊椎動(dòng)物多趨于退化；第三、四對咽囊的上皮形成甲狀旁腺（背側(cè)）和胸腺（腹側(cè)）；第五對咽囊的上皮形成后鰓體，該腺體位于甲狀腺旁，分泌的激素稱降鈣素，其生理作用主要是調(diào)節(jié)血漿中鈣離子的濃度。咽囊的底面中央處發(fā)生出甲狀腺。