京都基因和基因組百科全書(KEGG)是系統(tǒng)分析基因功能,聯(lián)系基因組信息和功能信息的知識庫。基因組信息存儲在GENES數(shù)據(jù)庫里,包括完整和部分測序的基因組序列;更高級的功能信息存儲在PATHWAY數(shù)據(jù)庫里,包括圖解的細胞生化過程如代謝、膜轉(zhuǎn)運、信號傳遞、細胞周期,還包括同系保守的子通路等信息;KEGG的另一個數(shù)據(jù)庫是LIGAND,包含關(guān)于化學(xué)物質(zhì)、酶分子、酶反應(yīng)等信息。KEGG提供了Java的圖形工具來訪問基因組圖譜,比較基因組圖譜和操作表達圖譜,以及其它序列比較、圖形比較和通路計算的工具,可以免費獲取。