第一類，植物性轉基因食品。這類食品比較多。如，面包生產需要高蛋白質含量的小麥，而目前小麥品種含高蛋白質較低，將高效的蛋白基因轉入小麥，將會使做成的面包具有更好的烘烤性能。 　　第二類，動物性轉基因食品。如在豬的基因組中轉入人的生長素基因，豬的生長速度增加了一倍，豬肉質量大大提高，現在這樣的豬肉已在澳大利亞被批準登上餐桌。
　　第三類，轉基因微生物食品。如生產奶酪的凝乳酶，以往只能從殺死的小牛的胃中才能取出，現在利用轉基因微生物已能夠使凝乳酶在體外大量產生，避免了小牛的無辜死亡，也降低了生產成本。
　　第四類，轉基因特殊食品。如科學家利用生物遺傳工程，將普通的蔬菜、水果、糧食等農作物，變成能預防疾病的神奇的“疫苗食品”