儀器數(shù)據(jù)采集在LIMS建設(shè)過(guò)程中,主要目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)從LIMS中將樣品編號(hào)、檢驗(yàn)檢測(cè)項(xiàng)目、方法等發(fā)送到儀器設(shè)備工作站,并從儀器設(shè)備工作站中將樣品編號(hào),檢驗(yàn)檢測(cè)項(xiàng)目、方法、結(jié)果,質(zhì)控結(jié)果等信息發(fā)送到LIMS中,從而實(shí)現(xiàn)雙方向的數(shù)據(jù)自動(dòng)傳輸。儀器設(shè)備的數(shù)據(jù)采集是LIMS能夠極大提升檢驗(yàn)檢測(cè)人員效率的功能,因此是否進(jìn)行了儀器采集、儀器采集覆蓋實(shí)驗(yàn)室的儀器數(shù)量、是否進(jìn)行雙向傳輸?shù)冉?jīng)常作為L(zhǎng)IMS提升效率的關(guān)鍵評(píng)判標(biāo)準(zhǔn)。
儀器數(shù)據(jù)采集概述
根據(jù)儀器是否具備雙向傳輸條件,將儀器數(shù)據(jù)采集劃分為雙向傳輸儀器數(shù)據(jù)采集和單向傳輸儀器數(shù)據(jù)采集。要實(shí)現(xiàn)雙向傳輸,主要有兩種方式一種是通過(guò)與網(wǎng)絡(luò)化色諧工作結(jié)(如:Empower、CDS等)集成進(jìn)行雙向傳輸;另一種是直接通過(guò)僅器設(shè)備提供的接口協(xié)議進(jìn)行數(shù)據(jù)傳輸。
根據(jù)儀器設(shè)備提供的數(shù)據(jù)傳給接口、工作站的情況等,將儀器數(shù)據(jù)采集劃分為串口數(shù)據(jù)采集、并口儀器數(shù)據(jù)采集、網(wǎng)口儀器數(shù)據(jù)采集、藍(lán)牙儀器數(shù)據(jù)采集、文件儀器數(shù)據(jù)采集等不同的種類(lèi),但是,在LIMS建設(shè)過(guò)程中,為了達(dá)到儀器接口的統(tǒng)一性,一般會(huì)輔以硬件資源。
將不同的接口轉(zhuǎn)化為統(tǒng)一的接口方式,例如,將串口、并口、藍(lán)牙等通過(guò)相應(yīng)的轉(zhuǎn)換器直接轉(zhuǎn)換為統(tǒng)一的無(wú)線(xiàn)網(wǎng)絡(luò)傳輸,這樣在LlMS中只需要針對(duì)網(wǎng)絡(luò)傳輸協(xié)議進(jìn)行數(shù)據(jù)處理即可。
需要說(shuō)明的是,為使數(shù)據(jù)在儀器和LIMS之間傳輸,需要將儀器產(chǎn)生的數(shù)據(jù)上網(wǎng),但是考慮到實(shí)驗(yàn)室儀器直接接入互聯(lián)網(wǎng)會(huì)造成潛在的安全風(fēng)險(xiǎn),所以?xún)H將儀器接入安全的局域網(wǎng),同時(shí)要保證,儀器聯(lián)網(wǎng)技術(shù)不能與儀器工作站的軟件產(chǎn)生沖突。
儀器采集4種方式
01串口輸入設(shè)備采集
宿主服務(wù)下達(dá)采集指令,采集端接收到消息指令通過(guò)串口采集設(shè)備檢測(cè)數(shù)據(jù),并將接收到的會(huì)話(huà)編碼一并提交宿主服務(wù)或保存采集主控端數(shù)據(jù)庫(kù)。
系統(tǒng)通過(guò)指定的串口號(hào)、波特率、數(shù)據(jù)位、停止位、校驗(yàn)位、數(shù)據(jù)類(lèi)型實(shí)時(shí)監(jiān)聽(tīng)串口變動(dòng),將監(jiān)聽(tīng)的數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)存在在系統(tǒng)緩存;
02.文件類(lèi)輸出設(shè)備采集
檢測(cè)人員掃碼將樣品編碼輸入檢測(cè)設(shè)備工作站系統(tǒng),當(dāng)檢測(cè)完成后,采集端通過(guò)監(jiān)聽(tīng)文件輸出實(shí)時(shí)解析檢測(cè)結(jié)果,并將檢測(cè)結(jié)果按照采集端報(bào)文格式保存到采集主控端數(shù)據(jù)庫(kù)。
03.數(shù)據(jù)庫(kù)類(lèi)輸出設(shè)備采集
檢測(cè)人員掃碼將樣品編碼輸入檢測(cè)設(shè)備工作站系統(tǒng),如果檢測(cè)設(shè)備支持寫(xiě)入則宿主服務(wù)可以自動(dòng)下發(fā)樣品編碼及相關(guān)數(shù)據(jù)。采集端定時(shí)檢查檢測(cè)設(shè)備工作站數(shù)據(jù)庫(kù)的輸出,獲取到檢測(cè)數(shù)據(jù)后按照采集端報(bào)文格式保存到采集主控端數(shù)據(jù)庫(kù)。
04.其他輸出設(shè)備采集
具體需要現(xiàn)場(chǎng)勘察調(diào)研而定。
采集工作站采集過(guò)程
1.所有數(shù)據(jù)統(tǒng)一存儲(chǔ)于單機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù), 關(guān)聯(lián)人、機(jī)、料、法、環(huán)等信息 (如: 生產(chǎn)設(shè)備、產(chǎn)品批次、測(cè)量?jī)x器等),不能通過(guò)網(wǎng)絡(luò)訪(fǎng)問(wèn),只能通過(guò)本機(jī)計(jì)算機(jī)訪(fǎng)問(wèn)。后期也可作為L(zhǎng)IMS系統(tǒng)質(zhì)量大數(shù)據(jù)平臺(tái)的數(shù)據(jù)采集端使用,保證客戶(hù)不會(huì)重復(fù)投入;
2.數(shù)據(jù)采集功能,數(shù)據(jù)采集工具將以客戶(hù)端的形式運(yùn)行在與設(shè)備連接的工作站電腦上,主要負(fù)責(zé)將設(shè)備產(chǎn)生的完整的可輸出的原始結(jié)果提取到系統(tǒng),供實(shí)驗(yàn)室人員進(jìn)行報(bào)告生成、匯總等操作;
3.儀器數(shù)據(jù)采集采用系統(tǒng)+ActiveMQ消息服務(wù)器客戶(hù)端的形式實(shí)現(xiàn),數(shù)據(jù)采集分為兩部分,第一可將需要的樣本編號(hào)等信息以約定的形式發(fā)送給設(shè)備;
4.采集客戶(hù)端負(fù)責(zé)進(jìn)行實(shí)際的采集行為的處理,并將采集后的結(jié)果以消息的形式返回。采集客戶(hù)端還負(fù)責(zé)將設(shè)備所需的項(xiàng)目編號(hào)等信息以約定的形式發(fā)送給設(shè)備;
5.采集時(shí)根據(jù)各設(shè)備情況可分為手動(dòng)采集和自動(dòng)采集,手動(dòng)采集時(shí)由系統(tǒng)界面發(fā)起采集動(dòng)作;
6.采集客戶(hù)端實(shí)時(shí)監(jiān)聽(tīng)采集申請(qǐng),客戶(hù)端收到采集申請(qǐng)后進(jìn)行相應(yīng)設(shè)備結(jié)果的數(shù)據(jù)采集然后以消息的形式返回給系統(tǒng)完成數(shù)據(jù)采集;
7.自動(dòng)數(shù)據(jù)采集時(shí)由采集客戶(hù)端根據(jù)本地配置的采集規(guī)則進(jìn)行定時(shí)的結(jié)果掃描并將需要的數(shù)據(jù)回發(fā)給LIMS系統(tǒng);
8.實(shí)驗(yàn)人員將分析儀器檢測(cè)結(jié)果文件(如PDF、word、Excel、CSV、TXT ) 等從數(shù)據(jù)工作站中導(dǎo)出,存放至指定目錄下;
9.LIMS系統(tǒng)或者開(kāi)發(fā)的采集數(shù)據(jù)軟件定時(shí)掃描改文件夾,通過(guò)解析儀器的檢測(cè)結(jié)果文件的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)格式,從文件中提取實(shí)驗(yàn)室結(jié)果信息存儲(chǔ)至LIMS的檢測(cè)結(jié)果數(shù)據(jù)庫(kù)中。