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    Northern blotting

    放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-07-06

    1. 取RNA

    2. 將電泳槽和板,梳齒浸泡在3%H2O2中20-30分鐘,并吹干

    3. 跑1%瓊脂糖凝膠,檢測(cè)樣本RNA含量

    4. 變性膠

    在桌面上利用保險(xiǎn)膜鋪出一塊干凈的區(qū)域,將1.95g 瓊脂糖加入110ml 的 DEPC-H2O (加熱前可在三角瓶上做一個(gè)記號(hào),在加熱后把蒸發(fā)的水分補(bǔ)足)加熱沸騰,冷卻(補(bǔ)水)至60度左右。加入15ml 10xMOPS (PH8.0)和25ml 甲醛,混勻后倒膠,冷卻待用。

    5. 電泳液(1L)

    100ml 10xMOPS (PH7.0)

    800ml DEPC-H2O

    100ml 甲醛

    6. sample buffer(-70度保存)

    1650 μl 體系:

    200μl 10xMOPS (PH8.0)

    350μl 甲醛

    1ml 甲酰胺

    100μl loading buffer(DNA用染料)

    用槍吹吸混勻

    以樣品RNA : sample buffer= 1:3 (v:v) 的比例加入 (RNA marker 同樣)

    點(diǎn)樣前 68℃ 5分鐘(RNA marker 同樣)


    7.跑電泳

    120-150V,大約4-6小時(shí)(跑到整塊膠還剩下1/3)每半個(gè)小時(shí)吸一次陽(yáng)極的電泳液到陰極(平衡酸堿性),將膠切下。如加RNA marker 則用EB染5’,洗20’,將膠切去一個(gè)角作為位置記號(hào)。


    8. 轉(zhuǎn)膜

    轉(zhuǎn)膜液: 20xSSC:

    1000ml體系:

    175.3g NaCl

    88.2g 檸檬酸納

    NaOH 調(diào)節(jié)到PH7.0

    定容

    搭建鹽橋:將20XSSC倒入白磁盤(pán)中,上擔(dān)一塊玻璃板,用一張大濾紙,兩邊浸入白盤(pán)中SSC,注意:防止短路,接觸面不能有氣泡,上反放膠,覆與膠等大的尼龍膜,再覆等大的濾紙,再壓上一疊吸水紙,壓上重物。

    9. 壓膜16h以上,期間要換吸水紙。紫外交聯(lián)2’。7XSSC洗15’。用濾紙包膜,以培養(yǎng)皿壓住。

    10. 烘膜

    80℃ 2h

    舊膜以煮沸的洗膜液洗脫兩次,10’每次輕柔震蕩。

    11.預(yù)雜交

    先用水沖洗雜交管,再用洗膜液沖洗。

    加5ML 預(yù)雜交液(雜交液沒(méi)過(guò)膜即可)于雜交管中,將膜小心放入用雜交液將膜浸潤(rùn),使其貼在管壁上,不可有氣泡,有DNA的一面朝向管內(nèi),放入雜交爐中55度轉(zhuǎn)3hr以上,(舊膜半小時(shí))


    12. 探針標(biāo)記

    1. 做柱子

    用燒紅的針頭將0.5ml的離心管底部戳一個(gè)小洞,加入玻璃纖維將開(kāi)口堵住,入Sephadex G50 3000rpm 5’,待液體流盡后,加入TE洗滌三次(3000rpm 5’)。


    2. 標(biāo)探針

    在離心管中加入探針約2ul(20-70ng, 太多會(huì)競(jìng)爭(zhēng)性吸收同位素),

    oligo(kit1) 2μl

    buffer(kit2) 2.5μl,

    雙蒸水12.5μl,

    100℃ 5’,0℃ 5’

    再加入dNTP(kit4) 2.5μl.

    Klenow 1μl

    雙蒸水6ul

    -p32-dCTP 1.5μl,

    37℃水浴 20-30’

    加入TE 100μl,過(guò)柱純化,套上大1.5ML 安培管,3000 rpm 3-5min , 再加入100μl TE 洗柱子3000 rpm 3min, 加入4μl 6N NaOH 室溫變性5min(可先將NaOH加入管中)


    5.雜交

    將探針加入雜交管中(注意不要加在膜上)65℃雜交過(guò)夜(大于16小時(shí)),膜不能干掉。


    6.洗膜

    室溫下用少量洗膜液洗滌雜交膜3-5min,注意回收放射性洗液,倒入洗膜液,65℃ 10min 回收洗液,用放射性計(jì)數(shù)器測(cè)一下放射強(qiáng)度,視放射強(qiáng)度,然后重復(fù)1-2次。


    7.壓磷屏

    用保鮮膜將膜包好(液體要吸干),壓磷屏20hr左右,掃描觀察。

     

     

     
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