cDNA芯片與Oligo芯片、DNA芯片一樣歸屬于基因芯片，它是指對各種生物隨機克隆和隨機測序所得的cDNA片段進行歸類，并把每一類cDNA片段的代表克隆（代表一個獨立基因 ）經(jīng)過體外擴增，得到大小和序列不同的片段分別經(jīng)過純化后，利用機械手高速將它們高密度有序地點樣固定在玻片硅晶片或尼龍膜上，從而制備成cDNA微陣列，以此對各基因的表達情況進行同步分析。
cDNA芯片可以檢測待測樣品中是否有與之互補的序列。將待測樣品中的mRNA被提取后，通過反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)過程獲得標(biāo)記熒光的cDNA，與包含上千個基因的cDNA微陣列進行雜交反應(yīng)16小時后，將玻片上未互補結(jié)合反應(yīng)的片段洗去，再對玻片進行激光共聚焦掃描，測定微陣列上各點的熒光強度，推算出待測樣品中各種基因的表達水平。
與傳統(tǒng)的檢測RNA表達水平的技術(shù)相比較，cDNA芯片具備高通量的優(yōu)勢，它越來越被研究人員應(yīng)用于基因表達檢測，通過定量監(jiān)測大量基因表達水平在闡述基因功能、探索疾病原因及機理、發(fā)現(xiàn)可能的診斷及治療靶等方面。