酶促反應(yīng)動力學(xué)的研究有助于闡明酶的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,也可為酶作用機(jī)理的研究提供數(shù)據(jù);有助于尋找最有利的反應(yīng)條件,以最大限度地發(fā)揮酶催化反應(yīng)的高效率;有助于了解酶在代謝中的作用或某些藥物作用的機(jī)理等,因此對它的研究具有重要的理論意義和實踐意義。
一、酶濃度對反應(yīng)速度的影響
在一定的溫度和pH條件下,當(dāng)?shù)孜餄舛却蟠蟪^酶的濃度時,酶的濃度與反應(yīng)速度呈正比關(guān)系。
二、底物濃度對反應(yīng)速度的影響
在酶的濃度不變的情況下,底物濃度對反應(yīng)速度影響的作用呈現(xiàn)矩形雙曲線(rectangular hyperbola)。
在底物濃度很低時,反應(yīng)速度隨底物濃度的增加而急驟加快,兩者呈正比關(guān)系,表現(xiàn)為一級反應(yīng)。隨著底物濃度的升高,反應(yīng)速度不再呈正比例加快,反應(yīng)速度增加的幅度不斷下降。如果繼續(xù)加大底物濃度,反應(yīng)速度不再增加,表現(xiàn)為0級反應(yīng)。此時,無論底物濃度增加多大,反應(yīng)速度也不再增加,說明酶已被底物所飽和。所有的酶都有飽和現(xiàn)象,只是達(dá)到飽和時所需底物濃度各不相同而已。
。ㄒ唬┟茁戏匠淌
解釋酶促反應(yīng)中底物濃度和反應(yīng)速度關(guān)系的最合理學(xué)說是中間產(chǎn)物學(xué)說。酶首先與底物結(jié)合生成酶椀孜鋦春銜?中間產(chǎn)物),此復(fù)合物再分解為產(chǎn)物和游離的酶。
Michaelis和Menten在前人工作的基礎(chǔ)上,經(jīng)過大量的實驗,1913年前后提出了反應(yīng)速度和底物濃度關(guān)系的數(shù)學(xué)方程式,即著名的米椔?戲匠淌?michaelis menten equation)。
V=Vmax[S]/Km+[S]
Vmax指該酶促反應(yīng)的最大速度,[S]為底物濃度,Km是米氏常數(shù),V是在某一底物濃度時相應(yīng)的反應(yīng)速度。當(dāng)?shù)孜餄舛群艿蜁r,[S]《Km,則V≌Vmax/Km[S],反應(yīng)速度與底物濃度呈正比。當(dāng)?shù)孜餄舛群芨邥r,[S]》Km,此時V≌Vmax,反應(yīng)速度達(dá)最大速度,底物濃度再增高也不影響反應(yīng)速度。
。ǘ┟祝戏匠淌降耐茖(dǎo)
米-曼氏方程式提出后又經(jīng)riggs和Haldane的充實和發(fā)展,經(jīng)補(bǔ)充和發(fā)展的米-曼氏方程工推導(dǎo)如下:
(三)米氏常數(shù)的意義
當(dāng)反應(yīng)速度為最大速度一半時,米氏方程可以變換如下:
???Vmax=Vmax[S]/Km+[S]
??進(jìn)一步整理可得到:
??Km=[S]??
可知,Km值等于酶反應(yīng)速度為最大速度一半時的底物濃度。
因為Km=K2+K3/K1,當(dāng)K2》K3,即ES解離成E和S的速度大大超過分離成E和P的速度時,K3可以忽略不計,此時Km值近似于ES解離常數(shù)KS,此時Km值可用來表示酶對底物的親和力。
Km=K2/K1=[E][S]/[ES]=KS??
Km值愈大,酶與底物的親和力愈;Km值愈小,酶與底物親和力愈大。酶與底物親和力大,表示不需要很高的底物濃度,便可容易地達(dá)到最大反應(yīng)速度。但是KS值并非在所有酶促反應(yīng)中都遠(yuǎn)小于K2,所以Ks值(又稱酶促反應(yīng)的底物常數(shù))和Km值的涵義不同,不能互相代替使用。
Km值是酶的特征性常數(shù),只與酶的性質(zhì),酶所催化的底物和酶促反應(yīng)條件(如溫度、pH、有無抑制劑等)有關(guān),與酶的濃度無關(guān)。酶的種類不同,Km值不同,同一種酶與不同底物作用時,Km值也不同。各種酶的Km值范圍很廣,大致在10-1~10-6M之間。
當(dāng)K3不遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于K2和K1時,Km表示整個反應(yīng)的化學(xué)平衡的常數(shù)。
如果Km值已知,任何底物濃度時酶的飽和度(形成中間產(chǎn)物的酶占總酶的比例,saturation fraction fEs)fEs便可計算出來。
fES=[ES]/[Et]=K3[ES]/K3[Et]=V/Vmax=[S]/Km+[S]
(四)Km和Vmax的求法
從圖中很難精確地測出Km和Vmax.為此人們將米氏方程進(jìn)行種種變換,將曲線作圖轉(zhuǎn)變成直線作圖。
1.雙倒數(shù)作圖(double?reciprocal plot or Lineweaver?Burk plot)
將米氏方程兩邊取倒數(shù),可轉(zhuǎn)化為下列形式:
1/V=Km/Vmax.1/[S]+1/Vmax
可知,1/V對1/[S]的作圖得一直線,其斜率是Km/V,在縱軸上的截距為1/Vmax,橫軸上的截距為-1/Km.此作圖除用來求Km和Vmax值外,在研究酶的抑制作用方面還有重要價值。
2.V對V〖〗[S][SX)]法(Eadie?Hofstee plot)
將米氏方程經(jīng)移項整理后可寫成
VKm+V[S]=Vm[S]
V[S]=Vm[S]-VKm
故V=Vm-KmV/[S]
以V為縱坐標(biāo)對V/[S]橫坐標(biāo)作圖,所得直線,其縱軸的截距為Vmax,斜率為Km(圖2-11)。
必須指出米氏方程只適用于較為簡單的酶作用過程,對于比較復(fù)雜的酶促反應(yīng)過程,如多酶體系、多底物、多產(chǎn)物、多中間物等,還不能全面地籍此概括和說明,必須借助于復(fù)雜的計算過程。
三、pH對反應(yīng)速度的影響
酶反應(yīng)介質(zhì)的pH可影響酶分子,特別是活性中心上必需基團(tuán)的解離程度和催化基團(tuán)中質(zhì)子供體或質(zhì)子受體所需的離子化狀態(tài),也可影響底物和輔酶的解離程度,從而影響酶與底物的結(jié)合。只有在特定的pH條件下,酶、底物和輔酶的解離情況,最適宜于它們互相結(jié)合,并發(fā)生催化作用,使酶促反應(yīng)速度達(dá)最大值,這種pH值稱為酶的最適pH(optimum pH)。它和酶的最穩(wěn)定pH不一定相同,和體內(nèi)環(huán)境的pH也未必相同。
動物體內(nèi)多數(shù)酶的最適pH值接近中性,但也有例外,如胃蛋白酶的最適pH約1.8,肝精氨酸酶最適pH約為9.8(見表2-2)。
表2-2 一些酶的最適pH
酶 | 最適pH | 酶 | 最適pH | 酶 | 最適pH |
胃蛋白酶 | 1.8 | 過氧化氫酶 | 7.6 | 延胡索酸酶 | 7.8 |
胰蛋白酶 | 7.7 | 精氨酸酶 | 9.8 | 核糖核酸酶 | 7.8 |
最適pH不是酶的特征性常數(shù),它受底物濃度、緩沖液的種類和濃度以及酶的純度等因素的影響。
溶液的pH值高于和低于最適pH時都會使酶的活性降低,遠(yuǎn)離最適pH值時甚至導(dǎo)致酶的變性失活。測定酶的活性時,應(yīng)選用適宜的緩沖液,以保持酶活性的相對恒定。
四、溫度對反應(yīng)速度的影響
化學(xué)反應(yīng)的速度隨溫度增高而加快。但酶是蛋白質(zhì),可隨溫度的升高而變性。在溫度較低時,前一影響較大,反應(yīng)速度隨溫度升高而加快,一般地說,溫度每升高10℃,反應(yīng)速度大約增加一倍。但溫度超過一定數(shù)值后,酶受熱變性的因素占優(yōu)勢,反應(yīng)速度反而隨溫度上升而減緩,形成倒V形或倒U形曲線。在此曲線頂點所代表的溫度,反應(yīng)速度最大,稱為酶的最適溫度(optimum temperature)。
從動物組織提取的酶,其最適溫度多在35℃~40℃之間,溫度升高到60℃以上時,大多數(shù)酶開始變性,80℃以上,多數(shù)酶的變性不可逆。酶的活性雖然隨溫度的下降而降低,但低溫一般不破壞酶。溫度回升后,酶又恢復(fù)活性。臨床上低溫麻醉就是利用酶的這一性質(zhì)以減慢組織細(xì)胞代謝速度,提高機(jī)體對氧和營養(yǎng)物質(zhì)缺乏的耐受體,有利于進(jìn)行手術(shù)治療。
酶的最適溫度不是酶的特征性常數(shù),這是因為它與反應(yīng)所需時間有關(guān),不是一個固定的值。酶可以在短時間內(nèi)耐受較高的溫度,相反,延長反應(yīng)時間,最適溫度便降低。
五、抑制劑對反應(yīng)速度的影響
凡能使酶的活性下降而不引起酶蛋白變性的物質(zhì)稱做酶的抑制劑(inhibitor)。使酶變性失活(稱為酶的鈍化)的因素如強(qiáng)酸、強(qiáng)堿等,不屬于抑制劑。通常抑制作用分為可逆性抑制和不可逆性抑制兩類。
(一)不可逆性抑制作用(irreversible inhibition)
不可逆性抑制作用的抑制劑,通常以共價鍵方式與酶的必需基團(tuán)進(jìn)行不可逆結(jié)合而使酶喪失活性,按其作用特點,又有專一性及非專一性之分。
1.非專一性不可逆抑制
抑制劑與酶分子中一類或幾類基團(tuán)作用,不論是必需基團(tuán)與否,皆可共價結(jié)合,由于其中必需基團(tuán)也被抑制劑結(jié)合,從而導(dǎo)致酶的失活。某些重金屬(Pb++、Cu++、Hg++)及對氯汞苯甲酸等,能與酶分子的巰基進(jìn)行不可逆適合,許多以巰基作為必需基團(tuán)的酶(通稱巰基酶),會因此而遭受抑制,屬于此種類型。用二巰基丙醇(british anti?lewisite,BAL)或二巰基丁二酸鈉等含巰基的化合物可使酶復(fù)活。
2.專一性不可逆抑制
此屬抑制劑專一地作用于酶的活性中心或其必需基團(tuán),進(jìn)行共價結(jié)合,從而抑制酶的活性。有機(jī)磷殺蟲劑能專一作用于膽堿酯酶活性中心的絲氨酸殘基,使其磷酰化而不可逆抑制酶的活性。當(dāng)膽堿酯酶被有機(jī)磷殺蟲劑抑制后,膽堿能神經(jīng)末稍分泌的乙酰膽堿不能及時分解,過多的乙酰膽堿會導(dǎo)致膽堿能神經(jīng)過度興奮的癥狀。解磷定等藥物可與有機(jī)磷殺蟲劑結(jié)合,使酶和有機(jī)磷殺蟲劑分離而復(fù)活。
(二)可逆性抑制(reversible inhibition)
抑制劑與酶以非共價鍵結(jié)合,在用透析等物理方法除去抑制劑后,酶的活性能恢復(fù),即抑制劑與酶的結(jié)合是可逆的。這類抑制劑大致可分為以下二類。
1.競爭性抑制(competitive inhibition)
。1)含義和反應(yīng)式
抑制劑I和底物S對游離酶E的結(jié)合有競爭作用,互相排斥,已結(jié)合底物的ES復(fù)合體,不能再結(jié)合I.同樣已結(jié)合抑制劑的EI復(fù)合體,不能再結(jié)合S.?
抑制劑I在化學(xué)結(jié)構(gòu)上與底物S個相似,能與底物S競爭酶E分子活性中心的結(jié)合基團(tuán),因此,抑制作用大小取決于抑制劑與底物的濃度比,加大底物濃度,可使抑制作用減弱。
例如,丙二酸、蘋果酸及草酰乙酸皆和琥珀酸的結(jié)構(gòu)相似,是琥珀酸脫氫酶的競爭性抑制劑。
。2)反應(yīng)速度公式及作圖
按米氏公式推導(dǎo)方法,也可演算出競爭性抑制時,抑制劑、底物和反應(yīng)速度之間的動力學(xué)關(guān)系及其雙倒數(shù)方程式為:
有競爭性抑制劑存在的曲線與無抑制劑的曲線相交于縱坐標(biāo)I/Vmax處,但橫坐標(biāo)的截距,因競爭性抑制存在變小,說明該抑制作用,并不影響酶促反應(yīng)的最大速度,而使Km值變大。
很多藥物都是酶的競爭性抑制劑。例如磺胺藥與對氨基苯甲酸具有類似的結(jié)構(gòu),而對氨基苯甲酸、二氫喋呤及谷氨酸是某些細(xì)菌合成二氫葉酸的原料,后者能轉(zhuǎn)變?yōu)樗臍淙~酸,它是細(xì)菌合成核酸不可缺少的輔酶。由于磺胺藥是二氫葉酸合成酶的競爭性抑制劑,進(jìn)而減少菌體內(nèi)四氫葉酸的合成,使核酸合成障礙,導(dǎo)致細(xì)菌死亡?咕鲂-甲氧芐氨嘧啶(TMP)能特異地抑制細(xì)菌的二氫葉酸還原為四氫葉酸,故能增強(qiáng)磺胺藥的作用。
2.非競爭性抑制(non-competitive inhibition)
。1)含義和反應(yīng)式
抑制劑I和底物S與酶E的結(jié)合完全互不相關(guān),既不排斥,也不促進(jìn)結(jié)合,抑制劑I可以和酶E結(jié)合生成EI,也可以和ES復(fù)合物結(jié)合生成ESI.底物S和酶E結(jié)合成ES后,仍可與I結(jié)合生成ESI,但一旦形成ESI復(fù)合物,再不能釋放形成產(chǎn)物P.
I和S在結(jié)構(gòu)上一般無相似之處,I常與酶分子上結(jié)合基團(tuán)以外的化學(xué)基團(tuán)結(jié)合,這種結(jié)合并不影響底物和酶的結(jié)合,增加底物濃度并不能減少I對酶的抑制程度。
。2)反應(yīng)速度公式及作圖
按米氏公式推導(dǎo)方法可演算出非競爭性抑制時,抑制劑、底物濃度和反應(yīng)速度之間動力學(xué)關(guān)系:
有非競爭性抑制劑存在的曲線與無抑制劑存在的曲線相交于橫坐標(biāo)-1/Km處,縱坐標(biāo)截距,因非競爭性抑制劑的存在而變大,說明該抑制作用,并不影響底物與酶的親和力,而使酶促最大反應(yīng)速度變小。
如賴氨酸是精氨酸酶的競爭性抑制劑,而中性氨基酸(如丙氨酸)則是非競爭性抑制劑。
總上所述,酶的競爭性和非競爭性抑制可通過雙倒數(shù)作圖加以區(qū)別。Vmax不因競爭性抑制劑的存在而改變,Km則不因非競爭性抑制劑的存在而改變。
六、激活劑對酶促反應(yīng)速度的影響
能使酶活性提高的物質(zhì),都稱為激活劑(activator),其中大部分是離子或簡單的有機(jī)化合物。如Mg++是多種激酶和合成酶的激活劑,動物唾液中的α-淀粉酶則受Cl-的激活。